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N-Methyl Palbociclib (impurity of palbociclib)

别名: N-Methyl Palbociclib; Palbociclib Impurity 87; Pyrido-[2,3-d]-pyrimidin-7-one 55; 6-Acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-((5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl)amino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one; 6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-[[5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one; Pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one, 6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-[[5-(4-methyl-1-piperazinyl)-2-pyridinyl]amino]-; 6-Acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-((5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl)amino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one (Palbociclib Impurity);
目录号: V72153 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
N-甲基 Palbociclib 是 Palbociclib 的杂质。
N-Methyl Palbociclib (impurity of palbociclib) CAS号: 571189-51-0
产品类别: Drug Metabolite
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
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产品描述
N-甲基帕博西尼是帕博西尼的杂质。帕博西尼（PD 0332991）是一种口服生物活性CDK4和CDK6抑制剂。
N-甲基帕博西尼（CAS：571189-51-0）是一种与细胞周期蛋白依赖性激酶4/6 (CDK4/6) 抑制剂帕博西尼相关的特征杂质和分析标准品。其化学名称为N-甲基帕博西尼，以固体参考物质的形式供应。该化合物可用于药物研发过程中的分析化学、杂质分析、方法开发和质量控制，尤其适用于检测和定量帕博西尼原料药和成品中的杂质。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK4/CDK6
N-Methyl Palbociclib is an impurity of palbociclib (PD 0332991), which is an orally bioactive, selective CDK4 and CDK6 inhibitor. CDK4/6 are key regulators of the cell cycle, controlling the transition from the G1 phase to the S phase. As an impurity, N-Methyl Palbociclib may retain some structural similarity to the parent drug and could potentially interact with CDK4/6, but its precise binding affinity has not been characterized.
体外研究 (In Vitro)
利用高选择性小分子抑制剂抑制细胞周期蛋白依赖性激酶4和6 (Cdk4/6) 的药理学方法，有望为临床癌症治疗提供新的治疗方案。然而，如何实现对Cdk4/6相对于其他ATP依赖性激酶的高选择性，仍然是一个巨大的挑战。吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮类化合物为抑制包括Cdk在内的多种激酶提供了一个有效的平台。研究表明，在吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮的C2位引入2-氨基吡啶侧链，可以赋予抑制剂在体外对Cdk4/6的极高选择性。这种选择性在细胞中也得到了验证，其中选择性最高的抑制剂在浓度高达细胞增殖IC50值的100倍时，仍能阻断G1期细胞周期。根据其选择性特征和药代动力学特征，化合物 43 (PD 0332991) 被确定为治疗癌症的候选药物[1]。
作为一种药物杂质，N-甲基帕博西尼未进行独立的体外药理活性测试。其母体药物帕博西尼通过提高p21水平和降低细胞周期蛋白E2的表达，诱导乳腺癌细胞（例如MCF-7、MDA-MB-231、BT474）发生G1期细胞周期阻滞。该杂质预计不具有显著的独立活性，但可作为对照，以确保药物的纯度和疗效不受影响。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无关于N-甲基帕博西尼作为治疗药物的独立体内研究报道。作为一种杂质，它不用于发挥药理作用。母体药物帕博西尼的体内活性包括抑制异种移植模型中的肿瘤生长，以及对激素受体阳性乳腺癌患者具有显著的治疗效果。该杂质可能在药物代谢或合成后以痕量存在。
酶活实验
N-甲基帕博西尼用于非细胞分析方法的开发。通常将其溶解于DMSO或甲醇等有机溶剂中，配制成储备液（例如1 mg/mL）。然后将杂质标准品稀释至工作浓度（例如1-100 ug/mL），并通过高效液相色谱（HPLC）或液相色谱-质谱联用（LC-MS）进行分析。使用该标准品建立方法验证参数，例如线性、准确度、精密度、检测限（LOD）和定量限（LOQ）。
细胞实验
在细胞研究中，N-甲基帕博西尼不作为独立治疗药物使用。相反，它被用作分析标准品，用于定量帕博西尼处理后的细胞培养基或细胞裂解液中该杂质的含量。样品收集和蛋白质沉淀后，将标准品以固定浓度加入样品中进行液相色谱-质谱（LC-MS）分析。杂质与标准品的比值用于定量，以评估潜在的代谢转化。
动物实验
在体内研究中，通常不会给动物直接服用N-甲基帕博西尼。然而，它可以作为分析标准品，用于定量分析服用帕博西尼的动物血浆或组织样本中的杂质。样本采集和提取后，将已知浓度的杂质标准品加入样本中，然后进行液相色谱-质谱联用（LC-MS）分析，以确定生物基质中N-甲基帕博西尼的浓度，用于ADME和毒理学研究。
药代性质 (ADME/PK)
作为药物杂质标准品，N-甲基帕博西尼没有独立的药代动力学 (PK) 参数。母体药物帕博西尼的绝对口服生物利用度约为 46%，与人血浆蛋白的结合率很高（约 85%），末端消除半衰期约为 29 小时。预计该杂质的含量相对于母体药物而言非常低，并且如果在体内形成，其体内分布途径可能与母体药物相似。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
N-甲基帕博西尼在分析实验室中用作参考标准品。目前尚无该杂质化合物的具体毒性数据。然而，为了进行质量控制和杂质分析，已根据ICH指南制定了可接受的限度，以确保患者安全。使用该标准品时，建议采取处理有机化合物的标准实验室安全防护措施（佩戴手套、护目镜、通风橱）。本品不可用于人体食用。
参考文献
[1]. J Med Chem . 2005 Apr 7;48(7):2388-406. doi: 10.1021/jm049354h.
其他信息
N-甲基帕博西尼并非药物，而是一种已鉴定的杂质和分析标准品。它不具有获批的治疗用途，也不适用于人体。该化合物用于分析方法开发、方法验证 (AMV)、简略新药申请 (ANDA) 的质量控制 (QC) 应用，或用于帕博西尼的商业化生产。它可以作为参考标准品，并与药典标准（USP 或 EP）进行溯源。帕博西尼本身是一种经 FDA 批准用于治疗乳腺癌的药物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H31N7O2
分子量
461.56
精确质量
461.253
CAS号
571189-51-0
PubChem CID
5330298
外观&性状
Typically exists as Light yellow to yellow solids at room temperature
LogP
2.3
tPSA
94.6Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
803
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=C(C(=O)N(C2=NC(=NC=C12)NC3=NC=C(C=C3)N4CCN(CC4)C)C5CCCC5)C(=O)C
InChi Key
PBSZUBKCQUPZFE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H31N7O2/c1-16-20-15-27-25(28-21-9-8-19(14-26-21)31-12-10-30(3)11-13-31)29-23(20)32(18-6-4-5-7-18)24(34)22(16)17(2)33/h8-9,14-15,18H,4-7,10-13H2,1-3H3,(H,26,27,28,29)
化学名
6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-[[5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
别名
N-Methyl Palbociclib; Palbociclib Impurity 87; Pyrido-[2,3-d]-pyrimidin-7-one 55; 6-Acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-((5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl)amino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one; 6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-[[5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one; Pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one, 6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-[[5-(4-methyl-1-piperazinyl)-2-pyridinyl]amino]-; 6-Acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-2-((5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl)amino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one (Palbociclib Impurity);
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中，避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1666 mL 10.8328 mL 21.6657 mL
5 mM 0.4333 mL 2.1666 mL 4.3331 mL
10 mM 0.2167 mL 1.0833 mL 2.1666 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
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计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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