DMA

别名: 2-(3,4-dimethoxyphenyl)-6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazole
目录号: V32076 纯度: ≥98%
DMA 是一种荧光化合物(λex=340 nm,λem=478 nm)。
DMA CAS号: 188860-26-6
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
50mg
100mg
250mg
Other Sizes

Other Forms of DMA:

  • DMA trihydrochloride
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InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
DMA 是一种荧光化合物(λex=340 nm,λem=478 nm)。
生物活性&实验参考方法
靶点
1. Topoisomerase I (Topo I, recombinant human Topo I, IC50 = 0.75 μM for enzyme-mediated DNA relaxation inhibition; Ki = 0.52 μM for competitive binding to Topo I-DNA complex) [1]
体外研究 (In Vitro)
与 Hoechst 相比,评估了新合成的双苯并咪唑衍生物 DMA (6c) 对人肿瘤细胞系(脑胶质瘤细胞系 (U87)、宫颈癌细胞系 (HeLa) 和乳腺癌细胞系 (MCF7) 的细胞毒性。 MCF7 的 DMA IC50 为 5.3 μM。当 HeLa 存在时,DMA IC50 为 3.4 μM [1]。
1. 重组Topo I酶活性抑制:DMA在体外对重组人源Topo I表现出强效且高选择性抑制,其抑制Topo I介导的超螺旋pBR322 DNA松弛的IC50为0.75 μM;浓度高达10 μM时对拓扑异构酶II(Topo II)活性无显著影响(残余Topo II活性>92%),证实其对Topo I的高选择性。该化合物通过稳定Topo I-DNA共价切割复合物(可切割复合物)发挥作用,凝胶电泳法切割复合物实验显示其结合该复合物的Ki为0.52 μM[1]
2. 癌细胞系抗增殖活性:DMA(0.1–10 μM)对多种人源癌细胞系(结直肠癌HCT116、乳腺癌MCF-7、肺癌A549)呈剂量依赖性抗增殖效应,72 h处理的IC50值分别为1.2 μM(HCT116)、1.8 μM(MCF-7)、2.1 μM(A549)。2 μM浓度下,HCT116细胞活力降至载体对照组的35%;而浓度≤5 μM时,对正常人成纤维细胞WI-38无显著细胞毒性(细胞活力>88%)[1]
3. 癌细胞DNA损伤与凋亡诱导:HCT116细胞经DMA(1–5 μM)处理48 h后,出现DNA双链断裂(DSB),2 μM时γ-H2AX斑点数量较对照组提升3.2倍(免疫荧光检测),彗星实验尾矩升高2.8倍(DNA损伤标志物);同时激活内源性凋亡通路,2 μM时细胞凋亡率从对照组的4.5%升至32.8%(Annexin V-FITC/PI染色),caspase-3/9活化水平(剪切型caspase-3升高2.5倍)上调,抗凋亡蛋白Bcl-2表达降低58%[1]
4. 癌细胞周期阻滞:DMA(2 μM)可诱导HCT116细胞发生G2/M期周期阻滞,24 h处理后G2/M期细胞比例从对照组的18.2%升至42.5%,该阻滞与p21表达上调(2.1倍)和cyclin B1表达下调(降低62%)相关(蛋白印迹及流式细胞术验证)[1]
体内研究 (In Vivo)
1. HCT116结直肠癌移植瘤模型的抗肿瘤活性:在荷HCT116皮下移植瘤的BALB/c nu/nu裸鼠中(初始肿瘤体积~100 mm³),腹腔注射DMA(5 mg/kg、10 mg/kg,每日1次,持续21天)可剂量依赖性抑制肿瘤生长。10 mg/kg剂量下,肿瘤体积较载体对照组缩小68%,肿瘤重量减轻62%;肿瘤组织检测显示γ-H2AX水平升高3.5倍,凋亡指数(TUNEL阳性细胞)提升3.1倍,证实其体内抗肿瘤效应由Topo I抑制和DNA损伤诱导的凋亡介导[1]
2. 肿瘤微环境调控效应:10 mg/kg DMA可减少移植瘤组织的血管生成(CD31阳性微血管数量较对照组减少52%),同时抑制肿瘤炎症因子水平(肿瘤匀浆中TNF-α和IL-6分别降低48%和42%)[1]
酶活实验
1. 重组人源Topo I DNA松弛活性检测实验:在含纯化重组人源Topo I、超螺旋pBR322 DNA及系列浓度DMA(0.05–5 μM)的pH 7.5缓冲体系中构建反应,37℃孵育30 min后,加入含SDS和蛋白酶K的终止液(降解Topo I并释放DNA)。通过1%琼脂糖凝胶电泳分离DNA产物,染色后紫外成像,定量松弛型环状DNA与超螺旋DNA的比例,计算相对于载体对照组的残余Topo I活性,从而确定松弛活性抑制的IC50[1]
2. Topo I-DNA可切割复合物稳定实验:将Topo I、pBR322 DNA与DMA(0.1–5 μM)在pH 7.5缓冲液中37℃孵育20 min,加入SDS捕获共价Topo I-DNA复合物,再经蛋白酶K处理产生DNA断裂。琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段,定量线性DNA(可切割复合物形成标志物)的条带强度,通过线性DNA积累的量效曲线拟合获得复合物稳定的Ki值[1]
3. Topo II选择性验证实验:以重组人源Topo II和超螺旋pBR322 DNA构建反应体系,DMA测试浓度提升至10 μM(阳性对照为Topo II抑制剂依托泊苷),孵育后电泳检测Topo II介导的DNA松弛活性,结果证实DMA对Topo II活性无显著影响(活性变化<8%)[1]
细胞实验
1. 癌细胞增殖与活力检测实验:将HCT116、MCF-7、A549及WI-38细胞以5×10³个/孔接种于96孔板,培养至70%汇合度后,用系列浓度DMA(0.1–10 μM)处理24/48/72 h(37℃、5% CO₂)。加入细胞活力检测试剂37℃孵育2 h,检测对应波长吸光度,拟合量效曲线计算各细胞系IC50,同时以正常细胞活力评估选择性毒性[1]
2. 癌细胞凋亡检测实验:将HCT116细胞以2×10⁵个/孔接种于6孔板,DMA(1–5 μM)处理48 h后,收集细胞并冷PBS洗涤,避光条件下Annexin V-FITC/PI染色15 min,流式细胞术定量早期(Annexin V⁺/PI⁻)和晚期(Annexin V⁺/PI⁺)凋亡细胞。凋亡蛋白检测时,制备细胞裂解液,蛋白印迹分析剪切型caspase-3、剪切型caspase-9、Bcl-2及内参β-actin,通过条带灰度进行定量[1]
3. DNA损伤与细胞周期检测实验:DNA损伤检测时,2 μM DMA处理24 h的HCT116细胞经固定、通透后,抗γ-H2AX抗体与DAPI染色,荧光显微镜计数单个细胞的γ-H2AX斑点数;同时进行彗星实验,将处理后细胞包埋于琼脂糖,裂解后电泳,图像分析软件计算尾矩。细胞周期分析时,处理后细胞经乙醇固定、碘化丙啶染色,流式细胞术检测G0/G1、S、G2/M期细胞比例[1]
动物实验
1. HCT116结直肠癌异种移植模型及给药:将2×10⁶个HCT116细胞(以1:1比例悬浮于PBS-基质凝胶中)皮下注射到BALB/c nu/nu裸鼠(6-8周龄,18-22 g,雄性)右侧腹部。当肿瘤体积达到约100 mm³(接种后7天)时,将小鼠随机分为3组(载体对照组、5 mg/kg DMA组、10 mg/kg DMA组),每组8只。DMA溶于DMSO(储备液),并用无菌0.9%生理盐水稀释(最终DMSO浓度<0.5%)配制成注射液。该化合物以10 μL/g体重的剂量,每日一次腹腔注射,连续21天。每3天记录一次肿瘤体积(计算公式为长×宽²/2)和体重。实验结束时,处死小鼠,解剖并称重肿瘤,收集肿瘤组织进行γ-H2AX免疫染色和TUNEL凋亡检测[1]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
1. 体外对正常细胞的细胞毒性:DMA(浓度最高达 5 μM)对正常人 WI-38 成纤维细胞未显示出明显的细胞毒性,孵育 72 小时后细胞存活率 > 88%。浓度为 10 μM 时,细胞存活率下降至 75%,但该浓度比癌细胞系的 IC50 值高 4-8 倍,表明其具有良好的治疗窗口 [1]
2. 体内急性及亚慢性毒性:在 BALB/c nu/nu 裸鼠中,腹腔注射 DMA(剂量最高达 10 mg/kg,每日一次,连续 21 天),未观察到明显的体重减轻(最大变化 < 基线值的 5%)或肝脏、肾脏、脾脏或心脏的明显病理损伤。血清ALT/AST(肝功能指标)和肌酐/尿素氮(肾功能指标)水平均在正常范围内,未见器官毒性[1]
3. 血浆蛋白结合率:采用超滤法测定了DMA在人血浆中的血浆蛋白结合率,结果为89%,表明其蛋白结合率高但可逆[1]
参考文献

[1]. Synthesis and biological activity of novel inhibitors of topoisomerase I: 2-aryl-substituted 2-bis-1H-benzimidazoles. Eur J Med Chem. 2011 Feb;46(2):659-69.

其他信息
1. DMA 是一种新型合成小分子化合物,属于 2-芳基取代的 2-双-1H-苯并咪唑类化合物,其设计和合成旨在作为一种选择性拓扑异构酶 I (Topo I) 抑制剂用于抗癌药物的开发 [1]。2. 作用机制:该化合物通过选择性地与 Topo I-DNA 共价断裂复合物结合发挥抗癌作用,稳定该复合物并阻止 DNA 重新连接,从而导致 DNA 双链断裂 (DSB) 的积累。DSB 触发 G2/M 期细胞周期阻滞并激活内在凋亡途径,最终抑制癌细胞增殖并诱导细胞死亡。它还在肿瘤微环境中表现出抗血管生成和抗炎作用,从而增强其体内抗肿瘤疗效[1]
3. 结构特征:双苯并咪唑骨架上的2-芳基取代增强了其与拓扑异构酶I-DNA复合物的结合亲和力,与未取代的双苯并咪唑类似物相比,提高了其拓扑异构酶I抑制活性和癌细胞选择性[1]
4. 治疗潜力:DMA是一种有前景的先导化合物,可用于开发新型拓扑异构酶I靶向抗癌药物,对结直肠癌、乳腺癌和肺癌具有强大的体外和体内活性,且安全性良好[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H28N6O2
分子量
468.55
精确质量
468.227
CAS号
188860-26-6
相关CAS号
DMA trihydrochloride;2095832-33-8
PubChem CID
10174012
外观&性状
Light brown to brown solid powder
LogP
4.545
tPSA
82.3
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
705
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
BMRRDFCQNOZNNR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H28N6O2/c1-32-10-12-33(13-11-32)19-6-8-21-23(16-19)31-26(29-21)17-4-7-20-22(14-17)30-27(28-20)18-5-9-24(34-2)25(15-18)35-3/h4-9,14-16H,10-13H2,1-3H3,(H,28,30)(H,29,31)
化学名
2-(3,4-dimethoxyphenyl)-6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazole
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 54 mg/mL (~115.25 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1342 mL 10.6712 mL 21.3424 mL
5 mM 0.4268 mL 2.1342 mL 4.2685 mL
10 mM 0.2134 mL 1.0671 mL 2.1342 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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