Oligomycin B

别名: Oligomycin B; 11050-94-5; Oligomycin A, 28-oxo-; 387OE420H7; EINECS 234-275-5; BRN 5705502; (1R,4E,5'S,6S,6'S,7R,8S,10R,11R,12S,14R,15S,16R,18E,20E,22R,25S,27S,28S,29R)-22-ethyl-7,11,14,15-tetrahydroxy-6'-[(2R)-2-hydroxypropyl]-5',6,8,10,12,14,16,28,29-nonamethyl-5',6'-dihydro-3H,9H,13H-spiro[2,26-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-4,18,20-triene-27,2'-pyran]-3,3',9,13(4'H)-tetrone; 28-OXOOLIGOMYCIN A; 寡霉素B;2-([(6-甲基-2-吡啶基)氨基]甲基)苯酚;寡霉素 B
目录号: V33890 纯度: ≥98%
Oligomycin B 是一种从链霉菌属中获得的抗生素。
Oligomycin B CAS号: 11050-94-5
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
500mg
1g
Other Sizes

Other Forms of Oligomycin B:

  • 21-Hydroxyoligomycin A
  • 寡霉素A
  • Oligomycin E
  • 寡霉素
  • 芦他霉素
  • 寡霉素C
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InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
Oligomycin B 是一种从链霉菌属中获得的抗生素。它是真核细胞ATP合成酶(ATP合成酶)的抑制剂(阻断剂/拮抗剂),可引起细胞凋亡。
生物活性&实验参考方法
靶点
ATP synthase; Antibiotic
体外研究 (In Vitro)
从海洋链霉菌B8496和B8739发酵液中分离得到4种抗生素,分别为帕霉素、低霉素A、低霉素B和青孢素。生物测定显示,这些化合物都以剂量和时间依赖的方式损害了葡萄假单胞游动孢子的运动性并导致随后的裂解。帕霉素的运动抑制和裂解活性最强(IC50为0.1 μ mL(-1)),其次是低霉素B (IC50为0.15和0.2 μ mL(-1))和低霉素F (IC50为0.3和0.5 μ mL(-1))。寡霉素A和棘孢素对游动孢子也有运动抑制作用,IC50值分别为3.0和10.0 μ mL(-1)。这是首次报道这些抗生素对植物致病性peronosporomyter的游动孢子的运动抑制和裂解活性。所有分离化合物的结构都是根据详细的光谱分析确定的。[2]
体内研究 (In Vivo)
游动孢子的产生及生物测定[2]
为分离葡萄侵染叶片的葡萄浆原菌孢子囊。在含1.5%水琼脂的培养皿中,在25°C和95%相对湿度条件下,在葡萄幼苗叶片下表面连续培养该菌株(Islam and Tiedemann 2011;Islam, Tiedemann and Laatsch 2011)。培养第6天,用微型真空吸尘器将含有柠檬形孢子囊的孢子囊收集到埃本多夫小瓶中。将新鲜收获的孢子囊与孢子囊分离,用尼龙筛(50目)过滤,蒸馏水洗涤2次,室温(23℃)消毒后的自来水(3 × 104个/ mL)黑暗培养6 h,释放运动孢子。游动孢子在灭菌水中保持运动长达12小时,并用于运动生物测定(Islam和Tahara 2001)。首先用二甲基亚砜(DMSO)配制抗生素原液,然后用蒸馏水稀释。游动孢子悬浮液中DMSO的最终浓度从未超过1% (v/v),这一条件不影响游动孢子的运动。化合物对游动孢子的活力和活力的影响采用先前描述的方案进行了分析(Islam等,2005;Abdalla等人2011;Islam, Tiedemann and Laatsch 2011)。在光镜下观察游动孢子的运动。如前所述,对游动孢子的运动性和裂解的时间变化进行了量化(Islam, Tiedemann和Laatsch 2011)。每个治疗重复三次。计算各处理染病孢子的平均值%±SE(标准误差),并通过单、双向方差分析(ANOVA)和t检验确定统计学显著性。采用双因素方差分析(见表S1,支持信息)检验抗生素在不同治疗时间和剂量下的运动抑制和溶解活性差异的显著性。以P < 0.05为差异有统计学意义。
细胞实验
疥癣素酯(SEs)是最近从黄斑地衣(Xanthoparmelia scabrosa)中分离到的一种具有活性二硫键的epipolythiiodioxopiperazine (ETP)类次生代谢产物。集落形成试验表明,这些毒素在纳摩尔浓度下对人类肿瘤细胞系有活性。ETP类毒素的其他成员,如胶质毒素,已被证明可诱导细胞凋亡,尽管ETP毒素的细胞靶点目前尚不清楚。ETP毒素已被证明通过与敏感的半胱氨酸残基相互作用抑制多种酶。通过JC-1染色,我们发现典型的醋酸丁酸皂素酯诱导早期线粒体膜超极化,并伴有细胞凋亡。该毒素降低完整细胞中的ATP并抑制渗透细胞中ATP的合成速率。与已知的ATP合成酶抑制剂寡霉素B的作用比较,ATP合成酶作为皂素酯诱导细胞死亡的早期靶点是一致的[1]。
动物实验
Production of zoospores and bioassay[2]
For the isolation of sporangia of Plasmopara viticola, infected leaves of grapevine. The strain was maintained by continuous culturing on the lower surface of young grapevine leaves on Petri dishes containing 1.5% water agar at 25°C and 95% relative humidity (Islam and Tiedemann 2011; Islam, Tiedemann and Laatsch 2011). On the sixth day of cultivation, the sporangiophores containing the lemon-shaped sporangia were harvested into an Eppendorf vial by a micro-vacuum cleaner. The freshly harvested sporangia were separated from sporangiophores by filtration through a nylon sieve (50 mesh), washed twice with distilled water and then incubated in sterilized tap water (3 × 104 sporangia per mL) in the dark for 6 h at room temperature (23°C) to release zoospores. The zoospores remained motile up to 12 h in sterilized water, and they were used for the motility bioassay (Islam and Tahara 2001). Stock solutions of the antibiotics were first prepared in dimethyl sulfoxide (DMSO) and then diluted with distilled water. The final concentration of DMSO in the zoospore suspension never exceeded 1% (v/v), a condition that does not affect zoospore motility. The effects of compounds on motility and viability of zoospores were assayed using protocols described earlier (Islam et al.2005; Abdalla et al.2011; Islam, Tiedemann and Laatsch 2011). Motility of the zoospores was observed under a light microscope at 100-fold magnification. Quantification of time-course changes of motility and lysis of the zoospores were carried out as described earlier (Islam, Tiedemann and Laatsch 2011). Each treatment was replicated three times. The mean value % ±SE (standard error) of the affected spores in each treatment was calculated and the statistical significance was determined by one- and two-way Analysis of Varience (ANOVA) and t-test. Two-way ANOVA (see Table S1, Supporting Information) was used to test the significance of differences in motility inhibition and lytic activities of the antibiotics at different times and doses of treatment. The difference is considered statistically significant with a value of P < 0.05.
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
mouse LD50 intraperitoneal 2900 ug/kg
参考文献

[1]. Evidence that the lichen-derived scabrosin esters target mitochondrial ATP synthase in P388D1 cells. Toxicol Appl Pharmacol. 2003 Aug 1;190(3):232-40.

[2]. Oligomycins and pamamycin homologs impair motility and induce lysis of zoospores of the grapevine downy mildew pathogen, Plasmopara viticola. FEMS Microbiol Lett. 2016 Aug;363(16).

其他信息
Oligomycin B is an oligomycin with formula C45H72O12 that is oligomycin A in which the spirocyclic ring bearing the 2-hydroxypropyl substituent has been substituted by an oxo group at the carbon which is directly attached to the spirocentre. It is a nonselective inhibitor of the mitochondrial F1F0 ATP synthase. It has a role as an EC 3.6.3.14 (H(+)-transporting two-sector ATPase) inhibitor. It is an oligomycin, a triketone and a pentol.
Oligomycin A, 28-oxo- has been reported in Apis cerana with data available.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C45H72O12
分子量
805.04598
精确质量
804.502
CAS号
11050-94-5
相关CAS号
Oligomycin A;579-13-5;Oligomycin;1404-19-9;Oligomycin D;1404-59-7;Oligomycin C;11052-72-5
PubChem CID
76958645
外观&性状
Typically exists as White to off-white solid at room temperature
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
911.4±65.0 °C at 760 mmHg
熔点
160-161℃
闪点
260.3±27.8 °C
蒸汽压
0.0±0.6 mmHg at 25°C
折射率
1.547
LogP
5.5
tPSA
197.12
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
57
分子复杂度/Complexity
1470
定义原子立体中心数目
18
SMILES
CC[C@@H]1C=CC=CC[C@H](C)[C@H]([C@@](C)(C(=O)[C@H](C)[C@H]([C@H](C)C(=O)[C@H](C)[C@H]([C@H](C)C=CC(=O)O[C@H]2[C@@H](C)[C@@H](CC1)O[C@]3([C@@H]2C)C(=O)C[C@@H](C)[C@@H](C[C@H](C)O)O3)O)O)O)O
InChi Key
QPRQJOHKNJIMGN-WVUAJZTGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C45H72O12/c1-12-33-17-15-13-14-16-25(3)42(52)44(11,54)43(53)31(9)40(51)30(8)39(50)29(7)38(49)24(2)18-21-37(48)55-41-28(6)34(20-19-33)56-45(32(41)10)36(47)22-26(4)35(57-45)23-27(5)46/h13-15,17-18,21,24-35,38,40-42,46,49,51-52,54H,12,16,19-20,22-23H2,1-11H3/b14-13+,17-15+,21-18+/t24-,25+,26-,27+,28+,29-,30-,31-,32-,33-,34-,35-,38+,40+,41+,42-,44+,45+/m0/s1
化学名
(1R,4E,5'S,6S,6'S,7R,8S,10R,11R,12S,14R,15S,16R,18E,20E,22R,25S,27S,28S,29R)-22-ethyl-7,11,14,15-tetrahydroxy-6'-[(2R)-2-hydroxypropyl]-5',6,8,10,12,14,16,28,29-nonamethylspiro[2,26-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-4,18,20-triene-27,2'-oxane]-3,3',9,13-tetrone
别名
Oligomycin B; 11050-94-5; Oligomycin A, 28-oxo-; 387OE420H7; EINECS 234-275-5; BRN 5705502; (1R,4E,5'S,6S,6'S,7R,8S,10R,11R,12S,14R,15S,16R,18E,20E,22R,25S,27S,28S,29R)-22-ethyl-7,11,14,15-tetrahydroxy-6'-[(2R)-2-hydroxypropyl]-5',6,8,10,12,14,16,28,29-nonamethyl-5',6'-dihydro-3H,9H,13H-spiro[2,26-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-4,18,20-triene-27,2'-pyran]-3,3',9,13(4'H)-tetrone; 28-OXOOLIGOMYCIN A;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2422 mL 6.2108 mL 12.4216 mL
5 mM 0.2484 mL 1.2422 mL 2.4843 mL
10 mM 0.1242 mL 0.6211 mL 1.2422 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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