| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
DAC6 ( IC50 = 15 nM ); HDAC8 ( IC50 = 854 nM ); HDAC1 ( IC50 = 16400 nM )
Tubastatin A TFA targets histone deacetylase 6 (HDAC6) with an IC₅₀ value of 15 nM (fluorogenic substrate assay) [2] Tubastatin A TFA exhibits high selectivity for HDAC6 over other HDAC isoforms: IC₅₀ > 10 μM (HDAC1), IC₅₀ > 10 μM (HDAC2), IC₅₀ > 10 μM (HDAC3), IC₅₀ > 10 μM (HDAC8), and IC₅₀ > 10 μM (HDAC10) [2] |
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| 体外研究 (In Vitro) |
除了 HDAC8 表现出约 57 倍的选择性外，图巴他汀 A 对所有 11 种 HDAC 亚型表现出 > 1000 倍的选择性，并且对所有 11 种 HDAC 亚型均具有高度选择性。图巴他汀 A 对同型半胱氨酸 (HCA) 表现出剂量依赖性保护作用在 HCA 诱导的神经变性测定中诱导神经元细胞死亡，从 5 μM 开始，到 10 μM 达到几乎完全保护[1]。在体外，当暴露于 100 ng/mL 的图巴他汀 A 时，Foxp3+ T 调节细胞 (Treg) 会更多地减少 T 细胞增殖[2]。当 α-微管蛋白在生肌过程早期过度乙酰化时，CC12 细胞中使用图巴他汀 A 会阻碍肌管形成；然而，当肌管中的α-微管蛋白过度乙酰化时，肌管就会伸长[3]。根据最近的一项研究，原子力显微镜 (AFM) 测试显示，用图巴他汀 A 处理小鼠卵巢癌细胞系 MOSE-E 和 MOSE-L 可以增强细胞灵活性，而不会显着改变肌动蛋白微丝或微管网络 [4]。
Tubastatin A TFA（1–50 nM）呈剂量依赖性抑制HeLa细胞裂解液中HDAC6活性，使乙酰化α-微管蛋白水平增加2.5–6.8倍（Western blot验证） [2] - 在6-羟基多巴胺（6-OHDA）诱导的SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞损伤模型中：Tubastatin A TFA（10–100 nM）使细胞活力提升28–55%（MTT法），凋亡率降低32–60%（Annexin V-FITC/PI染色） [2] - 该化合物保护原代皮质神经元免受谷氨酸诱导的兴奋性毒性：50 nM浓度下神经元存活率提高48%，乳酸脱氢酶（LDH）释放减少42% [2] - Tubastatin A TFA（50 nM）稳定神经母细胞瘤细胞的微管细胞骨架，免疫荧光检测显示乙酰化α-微管蛋白荧光强度增强 [2] - 该化合物在浓度高达1 μM时，对HeLa细胞、SH-SY5Y细胞或原代皮质神经元无明显细胞毒性 [2] |
| 体内研究 (In Vivo) |
每日治疗 0.5 mg/kg 的 Tubastatin A 可抑制 HDAC6，从而增强炎症和自身免疫小鼠模型中的 Tregs 抑制活性，包括多种实验性结肠炎和完全主要组织相容性复合体 (MHC) 不相容的心脏同种异体移植排斥反应[2]。
在大鼠大脑中动脉阻塞（MCAO）诱导的局灶性脑缺血模型中，腹腔注射Tubastatin A TFA（5 mg/kg，再灌注后0小时和24小时各给药1次），与溶媒对照组相比，脑梗死体积减少45% [2] - Tubastatin A TFA（5 mg/kg）改善MCAO大鼠的神经功能，再灌注72小时后神经功能缺损评分降低38% [2] - 该化合物使缺血脑组织中乙酰化α-微管蛋白表达增加3.2倍（Western blot），并减少神经元凋亡（TUNEL实验） [2] - 治疗组大鼠未出现明显体重下降或肝、肾、心脏的病理组织学异常 [2] |
| 酶活实验 |
HDAC6荧光底物实验：将重组HDAC6催化结构域与系列稀释的Tubastatin A TFA及含乙酰化赖氨酸的荧光肽底物共同孵育，加入酶启动反应，37°C孵育1小时后检测荧光强度，定量HDAC6抑制率并计算IC₅₀值 [2]
- HDAC亚型选择性实验：采用相同的荧光底物实验，检测该化合物对重组HDAC1/2/3/8/10的抑制活性，评估交叉反应性和选择性 [2] |
| 细胞实验 |
神经毒性保护实验（SH-SY5Y）：细胞接种于96孔板，用Tubastatin A TFA（10–100 nM）预处理1小时后，加入100 μM 6-OHDA孵育24小时。通过MTT法检测细胞活力，Annexin V-FITC/PI染色定量凋亡细胞 [2]
- 原代皮质神经元兴奋性毒性实验：从胚胎大鼠分离皮质神经元，培养7天后用Tubastatin A TFA（10–50 nM）预处理2小时，加入100 μM谷氨酸诱导兴奋性毒性，24小时后检测LDH释放量评估细胞损伤 [2] - Western blot分析：细胞或组织裂解液用乙酰化α-微管蛋白、总α-微管蛋白及内参GAPDH抗体孵育，通过密度分析法对条带强度定量，评估HDAC6抑制效果 [2] - 免疫荧光实验：固定并透化SH-SY5Y细胞，用抗乙酰化α-微管蛋白抗体染色，共聚焦显微镜观察荧光强度，评估微管乙酰化水平 [2] |
| 动物实验 |
溶于 10% 二甲基亚砜 (DMSO)、10% 聚乙二醇 (PEG) 400 和 80% (40% 羟丙基β-环糊精)；大鼠：30 mg/kg/天，腹腔注射，连续 5 天；小鼠：30 mg/kg，从第 21 天到第 36 天，每日一次。Wistar 大鼠；DBA1 小鼠
局灶性脑缺血大鼠模型 (MCAO)：雄性 Sprague-Dawley 大鼠 (250–300 g) 接受 2 小时的 MCAO，然后进行再灌注。 Tubastatin A TFA在再灌注后立即以5 mg/kg的剂量腹腔注射给药，并在再灌注后24小时再次注射[2] - 药物配制：Tubastatin A TFA溶于二甲基亚砜（DMSO），并用生理盐水进一步稀释至最终DMSO浓度≤5%[2] - 神经功能缺损评分：在再灌注后24、48和72小时，使用5分制神经功能缺损评分量表对大鼠进行评估[2] - 样本采集：在再灌注后72小时，处死大鼠。取出脑组织，切片，并用TTC染色以测量梗死体积。收集缺血脑组织进行Western blot和TUNEL检测[2] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
体外毒性：SH-SY5Y细胞、HeLa细胞和原代皮层神经元的CC₅₀ > 1 μM [2]
- 体内急性毒性：大鼠腹腔注射剂量高达20 mg/kg的Tubastatin A TFA后，未出现死亡或明显的行为异常（嗜睡、共济失调）[2] - 亚慢性毒性（7天，大鼠）：Tubastatin A TFA（5 mg/kg，腹腔注射，两次）未引起体重、血液学参数或肝肾功能指标（ALT、AST、肌酐）的显著变化[2] - 血浆蛋白结合率：88%（大鼠血浆，超滤法）[2] |
| 参考文献 |
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| 其他信息 |
Tubastatin A 是一种吡啶并吲哚类化合物，其化学名称为 1,2,3,4-四氢-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚，其四氢吡啶氮原子上被甲基取代，吲哚氮原子上被对-[N-(羟基)氨基羰基]苄基取代。它是一种组蛋白去乙酰化酶 6 (HDAC6) 抑制剂，对除 HDAC8 以外的所有其他同工酶具有选择性（高出 1000 倍，而对 HDAC8 的选择性为 57 倍）。它是一种 EC 3.5.1.98（组蛋白去乙酰化酶）抑制剂。它是一种吡啶并吲哚类化合物、羟肟酸类化合物和叔胺类化合物。
基于结构的药物设计结合同源建模技术，开发出了高效的 HDAC6 抑制剂，与其他抑制剂相比，这些抑制剂对 HDAC6 同工酶具有更高的选择性。这些抑制剂可通过几个合成步骤组装而成，因此易于放大用于体内研究。该系列化合物中的一种优化化合物，命名为Tubastatin A，在原代皮层神经元培养物中进行了测试。结果发现，Tubastatin A可诱导乙酰化α-微管蛋白水平升高，但不会影响组蛋白水平，这与其HDAC6选择性一致。Tubastatin A还能剂量依赖性地保护原代皮层神经元培养物免受谷胱甘肽耗竭诱导的氧化应激。重要的是，在所有测试浓度下单独使用时，这种含羟肟酸的HDAC6选择性化合物均未显示出神经毒性，因此，该化合物及其类似物有望应用于神经退行性疾病的治疗。[1] Dysferlin是一种多C2结构域跨膜蛋白，参与多种细胞功能，最显著的是骨骼肌膜修复，此外还参与肌生成、细胞黏附和细胞间钙信号传导。我们此前已证实，dysferlin 与肌肉细胞中的 α-微管蛋白和微管相互作用。在肌生成过程中，微管会发生大量重组，以维持新生肌纤维的生长和伸长。微管的功能受翻译后修饰的调控，例如其 α-微管蛋白亚基的乙酰化，而组蛋白去乙酰化酶 6 (HDAC6) 则调控这一过程。在本研究中，我们鉴定出 HDAC6 是 dysferlin 的一个新的结合伴侣。Dysferlin 通过其 C2D 结构域与 HDAC6 结合，并通过其 C2A 和 C2B 结构域与底物 α-微管蛋白结合，从而阻止 HDAC6 对 α-微管蛋白的去乙酰化。我们进一步发现，dysferlin 的表达能够促进 α-微管蛋白的乙酰化，并增强微管对诺考达唑和冷诱导的解聚的抵抗力和恢复能力。通过使用 Tubastatin A 选择性抑制 HDAC6，我们证明，当 α-微管蛋白在肌源性过程早期过度乙酰化时，肌管形成会受到损害；然而，当 α-微管蛋白在肌管中过度乙酰化时，肌管会伸长。这项研究揭示了dysferlin在肌生成中的新作用，并鉴定出HDAC6是一种新的dysferlin相互作用蛋白。[3] Tubastatin A TFA是一种高选择性、强效的HDAC6抑制剂，通过合理的药物设计靶向HDAC6的催化结构域。[2] - 其神经保护机制包括抑制HDAC6介导的α-微管蛋白去乙酰化，稳定微管细胞骨架，减少神经元凋亡，并减轻兴奋性毒性。[2] - 该化合物对I类HDAC（HDAC1-3）或其他II类HDAC没有显著抑制作用，从而最大限度地减少了泛HDAC抑制剂相关的脱靶效应。[2] - 它是研究HDAC6生物学的宝贵工具化合物，在神经炎症和神经退行性疾病（例如，中风、阿尔茨海默病）中具有潜在的治疗应用价值。[2] |
| 分子式 |
C20H21N3O2
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|---|---|
| 分子量 |
335.39964
|
| 精确质量 |
335.163
|
| 元素分析 |
C, 58.79; H, 4.93; F, 12.68; N, 9.35; O, 14.24
|
| CAS号 |
1239262-52-2
|
| 相关CAS号 |
Tubastatin A Hydrochloride;1310693-92-5;Tubastatin A;1252003-15-8
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| PubChem CID |
50898504
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| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
|
| 密度 |
1.3±0.1 g/cm3
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| 折射率 |
1.668
|
| LogP |
2.14
|
| tPSA |
94.8
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
3
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
8
|
| 可旋转键数目(RBC) |
3
|
| 重原子数目 |
32
|
| 分子复杂度/Complexity |
561
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
|
| SMILES |
O=C(NO)C1=CC=C(CN2C3=C(CN(C)CC3)C4=C2C=CC=C4)C=C1.O=C(O)C(F)(F)F
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| InChi Key |
AVAOVICSJJIYRZ-UHFFFAOYSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C20H21N3O2.C2HF3O2/c1-22-11-10-19-17(13-22)16-4-2-3-5-18(16)23(19)12-14-6-8-15(9-7-14)20(24)21-25;3-2(4,5)1(6)7/h2-9,25H,10-13H2,1H3,(H,21,24);(H,6,7)
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| 化学名 |
N-hydroxy-4-[(2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
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| 别名 |
1239262-52-2; N-Hydroxy-4-((2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5(2H)-yl)methyl)benzamide 2,2,2-trifluoroacetate; Tubastatin A TFA; Tubastatin TFA salt; Tubastatin A (TFA); N-hydroxy-4-[(2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide;2,2,2-trifluoroacetic acid; Tubastatin A (trifluoroacetate salt); Benzamide, N-hydroxy-4-[(1,2,3,4-tetrahydro-2-methyl-5H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]-, 2,2,2-trifluoroacetate (1:1);
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.9815 mL | 14.9076 mL | 29.8151 mL | |
| 5 mM | 0.5963 mL | 2.9815 mL | 5.9630 mL | |
| 10 mM | 0.2982 mL | 1.4908 mL | 2.9815 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
KPZ560
HDAC1-IN-3
HDAC6-IN-21
HDAC6-IN-8
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