| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
The target of LYN-1604 is UNC-51-like kinase 1 (ULK1), with an EC₅₀ value for activating ULK1 kinase activity determined by kinase assay; key amino acid residues involved in binding are LYS50, LEU53, and TYR89 of ULK1 [1]
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| 体外研究 (In Vitro) |
LYN-1604 有潜力成为 ULK1 激动剂（100 nM 时酶活性 = 195.7%，针对 MDA-MB-231 细胞的 IC50 = 1.66 μM）[1]。 LYN-1604 具有纳摩尔范围内的结合亲和力 (KD=291.4 nM)，可与野生型 ULK1 结合 [1]。在 MDA-MB-231 细胞上，LYN-1604（0.5、1.0 和 2.0 μM）通过 ULK 复合物导致细胞死亡[1].. 小时）显着增加 Beclin-1 表达，降解 p62，并导致 LC3-I在 MDA-MB-231 细胞中变成 LC3-II[1]。通过 ULK 复合物，LYN-1604 触发 ATG5 依赖性自噬[1]。此外，LYN-1604 能够触发细胞凋亡和促进 caspase3 裂解[1]。
1. 激活ULK1激酶活性：LYN-1604通过疏水相互作用结合ULK1的激酶结构域，呈剂量依赖性显著增强ULK1激酶活性，其EC₅₀值通过激酶活性剂量-反应曲线计算得出。ADP-Glo激酶实验和体外磷酸化实验显示，ULK1的LYS50、LEU53或TYR89残基突变后，LYN-1604的激活作用消失（mATG13的Ser318位点磷酸化受损）。表面等离子体共振（SPR）实验证实LYN-1604与野生型ULK1存在结合亲和力，而突变型ULK1的结合亲和力降低[1] 2. 诱导MDA-MB-231细胞自噬：LYN-1604（0.5μM、1.0μM、2.0μM）呈剂量依赖性增加MDC阳性自噬小体数量（荧光显微镜和流式细胞术检测）。蛋白质印迹（western blot）分析显示，LYN-1604浓度依赖性上调Beclin-1和LC3（LC3-I向LC3-II转化）的表达，下调p62的表达。转染GFP/mRFP-LC3质粒后，LYN-1604（2.0μM）处理可增强GFP-LC3斑点形成，与巴弗洛霉素A₁（Bafilomycin A₁，10nM）共孵育后斑点数量进一步增加，表明自噬流增强[1] 3. 抑制细胞活力并诱导凋亡：LYN-1604降低MDA-MB-231细胞活力（IC₅₀值通过MTT实验测定）。自噬抑制剂3-甲基腺嘌呤（3-MA，1mM）预处理1小时可显著逆转LYN-1604（2.0μM）诱导的细胞活力下降，证实自噬依赖性细胞死亡。Annexin-V/PI双染色流式细胞术显示，LYN-1604（2.0μM）呈时间依赖性诱导细胞凋亡。Western blot分析显示凋亡标志物caspase3和PARP发生剪切[1] 4. 调控ULK复合物及下游分子：LYN-1604（2.0μM）上调ULK1在Ser317位点的磷酸化（免疫细胞化学和western blot检测），并增强ULK复合物组分（ULK1、mATG13、FIP200、ATG101）的表达。siRNA沉默ULK1或ATG5可阻断LYN-1604诱导的LC3转化和p62降解，证实其通过ULK复合物诱导ATG5依赖性自噬。芯片分析鉴定ATF3、RAD21和caspase3为ULK1相互作用分子；LYN-1604上调ATF3和剪切型caspase3的表达，下调RAD21的表达，且该效应可被ULK1沉默逆转[1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
针对 ULK1 调节的细胞死亡，LYN-1604（低剂量：25 mg/kg；中剂量：50 mg/kg；高剂量：100 mg/kg）是一种胃内药物，每日一次，持续 14 天，可减少细胞的生长。异种移植TNBC [1]。
1. TNBC异种移植模型中的抗肿瘤活性：接种MDA-MB-231异种移植瘤的裸鼠（每组6只）接受LYN-1604或溶媒处理。与对照组相比，LYN-1604显著降低肿瘤体积和肿瘤重量（p<0.001，p<0.05）。肿瘤组织免疫组织化学显示，LYN-1604处理组p-ULK1（Ser317）阳性率显著升高。肿瘤组织western blot分析显示，ULK1、p-ULK1（Ser317）、LC3-II、Beclin-1表达上调，PARP发生剪切，与体外自噬和凋亡诱导结果一致[1] 2. 体内安全性：与溶媒组相比，LYN-1604处理未导致小鼠相对体重、肝指数、脾指数或肾指数发生显著变化，表明其体内耐受性良好[1] |
| 酶活实验 |
1. ULK1激酶活性实验（ADP-Glo实验）：将纯化的ULK1激酶与不同浓度的LYN-1604（初始筛选浓度包括100nM）在反应缓冲液中孵育。孵育后加入ADP-Glo试剂终止反应并将ADP转化为ATP，通过检测发光强度（RLU）量化ULK1激酶活性（空白组：无ULK1，0%活性；对照组：无LYN-1604，100%活性），根据标准化激酶活性的剂量-反应曲线计算EC₅₀值[1]
2. 体外磷酸化实验：从HEK-293T细胞中纯化野生型或突变型（K50A、L53A、Y89A）ULK1，以纯化的mATG13为底物，在有无LYN-1604存在的条件下进行反应。通过特异性抗体western blot检测mATG13在Ser318位点的磷酸化水平，并确认酶和底物的上样量一致[1] 3. 表面等离子体共振（SPR）实验：将野生型或突变型ULK1固定在Biacore传感器芯片上，将不同浓度的LYN-1604注入芯片，通过检测SPR信号评估结合亲和力，分析LYN-1604与ULK1的相互作用[1] 4. 分子动力学模拟：对LYN-1604与野生型或突变型ULK1的结合进行10ns的计算模拟。野生型和K50A/L53A突变型的结合构象稳定，而Y89A突变型不稳定，证实Y89在结合中的关键作用[1] |
| 细胞实验 |
细胞活力测定[1]
细胞类型： MDA-MB-231 细胞 测试浓度： 0.5、1.0 和 2.0 μM 孵育时间： 实验结果：诱导细胞死亡。自噬比率以剂量依赖性方式增加。 蛋白质印迹分析[1] 细胞类型： MDA-MB-231 细胞 测试浓度： 0、0.5、1、和 2 μM 孵育时间： 24 小时 实验结果： 诱导 Beclin-1 显着上调和 p62 降解作为 LC3-I 到 LC3-II 的转化。 1. 细胞活力实验（MTT实验）：将MDA-MB-231细胞接种于96孔板，用不同浓度的LYN-1604处理24小时。自噬抑制实验中，在LYN-1604处理前1小时加入3-MA（1mM）。加入MTT试剂后检测吸光度，计算细胞活力，使用Prism 6.0软件测定IC₅₀值[1] 2. 自噬小体检测（MDC染色）：用LYN-1604（0.5μM、1.0μM、2.0μM）处理MDA-MB-231细胞后，加入MDC染色。通过荧光显微镜观察自噬小体，流式细胞术量化MDC阳性细胞比例[1] 3. 自噬流实验：将MDA-MB-231细胞转染GFP/mRFP-LC3质粒，用LYN-1604（2.0μM）在有无巴弗洛霉素A₁（10nM）存在的条件下处理。通过荧光显微镜观察GFP-LC3斑点，western blot检测p62和LC3的表达以评估自噬流[1] 4. Western blot分析：用指定浓度和时间的LYN-1604处理MDA-MB-231细胞，制备细胞裂解液，经电泳分离蛋白后转移至膜上，用抗Beclin-1、p62、LC3、ULK1、p-ULK1（Ser317/Ser757）、ATF3、RAD21、caspase3、PARP和β-肌动蛋白（内参）的抗体进行孵育，检测并量化免疫反应条带[1] 5. 免疫细胞化学：用LYN-1604（2.0μM）处理MDA-MB-231细胞，固定并透化后，加入抗p-ULK1（Ser317）或LC3B的一抗孵育，再加入荧光标记的二抗。DAPI用于核染色，通过荧光显微镜观察并量化蛋白表达[1] 6. 凋亡实验（Annexin-V/PI双染色）：用LYN-1604（2.0μM）处理MDA-MB-231细胞指定时间后，收集细胞并加入Annexin-V和PI染色，流式细胞术分析凋亡比例[1] 7. siRNA转染实验：使用转染试剂将对照siRNA、ULK1 siRNA或ATF5 siRNA转染至MDA-MB-231细胞。转染后用LYN-1604（2.0μM）处理24小时，通过western blot分析或免疫细胞化学检测靶蛋白表达，评估基因沉默对LYN-1604诱导自噬和凋亡的影响[1] 8. 芯片分析：将MDA-MB-231细胞转染ULK1 siRNA或pcDNA3.1-ULK1，提取总RNA并进行芯片分析，鉴定表达变化相反的差异表达基因。通过western blot验证核心ULK1调控基因（包括ATF3、RAD21、caspase3）[1] |
| 动物实验 |
动物/疾病模型： 24只雌性裸鼠（BALB/c，6-8周龄，20-22克）[1]
剂量： 低剂量，25毫克/千克；中剂量，50毫克/千克；高剂量，100毫克/千克 给药途径： 灌胃（po）给药；每日一次，连续14天 实验结果： 显著抑制异种移植MDA-MB-231细胞的生长。小鼠体重稳定。实验结束时，部分组小鼠的肝脏和脾脏重量指数略有增加，而所有剂量组的肾脏重量指数均未受到影响。 1. TNBC异种移植模型建立：收集对数生长期的MDA-MB-231细胞，并重悬于适宜的培养基中。将MDA-MB-231细胞皮下接种于裸鼠，建立异种移植瘤模型。肿瘤形成后，将小鼠随机分为对照组（载体组）和LYN-1604治疗组（每组n=6）[1] 2. 给药：将LYN-1604溶解于适宜的载体中（未详细说明）。该药物以未指明的途径，按中位剂量和其他剂量（未明确说明）给药于小鼠，持续特定疗程直至研究终点[1] 3. 数据收集与分析：定期使用游标卡尺测量肿瘤体积（肿瘤体积 = 长 × 宽² / 2）。治疗结束后，处死小鼠并测量肿瘤重量。在整个研究过程中记录相对体重。收集肝脏、脾脏和肾脏以计算器官指数。肿瘤组织固定用于免疫组织化学（检测 p-ULK1），或冷冻用于蛋白质印迹分析（检测 ULK1、p-ULK1、LC3、Beclin-1、PARP）[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
1. 背景：ULK1是自噬的关键启动因子，其在乳腺癌组织中表达显著下调，尤其是在三阴性乳腺癌（TNBC）中。激活ULK1调控的自噬是TNBC的潜在治疗策略[1]
2. 化学结构：文献[1]中的图5A提供了LYN-1604的化学结构。 3. 作用机制：LYN-1604作为ULK1激动剂，通过LYS50、LEU53和TYR89残基与ULK1结合，激活其激酶活性。它通过 ULK 复合物 (ULK1-mATG13-FIP200-ATG101) 诱导 ATG5 依赖性自噬，并通过调节 ATF3、RAD21 和 caspase3 触发细胞凋亡，最终导致 TNBC 细胞死亡 [1] 4. 治疗潜力：LYN-1604 在体外和体内均表现出强大的抗肿瘤活性，且耐受性良好，使其成为一种有前景的 TNBC 小分子候选药物 [1] |
| 分子式 |
C33H43CL2N3O2
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|---|---|---|
| 分子量 |
584.63
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| 精确质量 |
583.273
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| CAS号 |
2088939-99-3
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| 相关CAS号 |
LYN-1604 dihydrochloride;2310109-38-5;LYN-1604 hydrochloride;2216753-86-3
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| PubChem CID |
131801113
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| 外观&性状 |
Colorless to light yellow oil
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| LogP |
7.6
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| tPSA |
36
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
12
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| 重原子数目 |
40
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| 分子复杂度/Complexity |
750
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
DVNVYWLKGWAELS-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C33H43Cl2N3O2/c1-24(2)19-37(20-25(3)4)22-33(39)38-15-13-36(14-16-38)21-32(30-12-11-29(34)18-31(30)35)40-23-26-9-10-27-7-5-6-8-28(27)17-26/h5-12,17-18,24-25,32H,13-16,19-23H2,1-4H3
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| 化学名 |
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.7105 mL | 8.5524 mL | 17.1048 mL | |
| 5 mM | 0.3421 mL | 1.7105 mL | 3.4210 mL | |
| 10 mM | 0.1710 mL | 0.8552 mL | 1.7105 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
dentification of LYN-1604 as a potent ULK1 agonist, and its binding mode.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
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LYN-1604 induces cell death in MDA-MB-231 cells.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
 LYN-1604 induces ATG5-dependent autophagyviathe ULK complex.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
 LYN-1604 induces autophagy involved in ATF3, RAD21, and caspase3.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
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 LYN-1604 has therapeutic potential, targeting ULK-modulated cell deathin vivo.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
 Biological evaluation of candidate ULK1 agonists toward human breast cancer cells.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
ULK1 Recombinant Human Active Protein Kinase
ULK-100
SBP-1750
DCC-3116
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