| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
The target of LYN-1604 is UNC-51-like kinase 1 (ULK1), with an EC₅₀ value for activating ULK1 kinase activity determined by kinase assay; key amino acid residues involved in binding are LYS50, LEU53, and TYR89 of ULK1 [1]
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| 体外研究 (In Vitro) |
LYN-1604 有潜力成为 ULK1 激动剂（100 nM 时酶活性 = 195.7%，针对 MDA-MB-231 细胞的 IC50 = 1.66 μM）[1]。 LYN-1604 具有纳摩尔范围内的结合亲和力 (KD=291.4 nM)，可与野生型 ULK1 结合 [1]。在 MDA-MB-231 细胞上，LYN-1604（0.5、1.0 和 2.0 μM）通过 ULK 复合物导致细胞死亡[1].. 小时）显着增加 Beclin-1 表达，降解 p62，并导致 LC3-I在 MDA-MB-231 细胞中变成 LC3-II[1]。通过 ULK 复合物，LYN-1604 触发 ATG5 依赖性自噬[1]。此外，LYN-1604 能够触发细胞凋亡和促进 caspase3 裂解[1]。
1. 激活ULK1激酶活性：LYN-1604通过疏水相互作用结合ULK1的激酶结构域，呈剂量依赖性显著增强ULK1激酶活性，其EC₅₀值通过激酶活性剂量-反应曲线计算得出。ADP-Glo激酶实验和体外磷酸化实验显示，ULK1的LYS50、LEU53或TYR89残基突变后，LYN-1604的激活作用消失（mATG13的Ser318位点磷酸化受损）。表面等离子体共振（SPR）实验证实LYN-1604与野生型ULK1存在结合亲和力，而突变型ULK1的结合亲和力降低[1] 2. 诱导MDA-MB-231细胞自噬：LYN-1604（0.5μM、1.0μM、2.0μM）呈剂量依赖性增加MDC阳性自噬小体数量（荧光显微镜和流式细胞术检测）。蛋白质印迹（western blot）分析显示，LYN-1604浓度依赖性上调Beclin-1和LC3（LC3-I向LC3-II转化）的表达，下调p62的表达。转染GFP/mRFP-LC3质粒后，LYN-1604（2.0μM）处理可增强GFP-LC3斑点形成，与巴弗洛霉素A₁（Bafilomycin A₁，10nM）共孵育后斑点数量进一步增加，表明自噬流增强[1] 3. 抑制细胞活力并诱导凋亡：LYN-1604降低MDA-MB-231细胞活力（IC₅₀值通过MTT实验测定）。自噬抑制剂3-甲基腺嘌呤（3-MA，1mM）预处理1小时可显著逆转LYN-1604（2.0μM）诱导的细胞活力下降，证实自噬依赖性细胞死亡。Annexin-V/PI双染色流式细胞术显示，LYN-1604（2.0μM）呈时间依赖性诱导细胞凋亡。Western blot分析显示凋亡标志物caspase3和PARP发生剪切[1] 4. 调控ULK复合物及下游分子：LYN-1604（2.0μM）上调ULK1在Ser317位点的磷酸化（免疫细胞化学和western blot检测），并增强ULK复合物组分（ULK1、mATG13、FIP200、ATG101）的表达。siRNA沉默ULK1或ATG5可阻断LYN-1604诱导的LC3转化和p62降解，证实其通过ULK复合物诱导ATG5依赖性自噬。芯片分析鉴定ATF3、RAD21和caspase3为ULK1相互作用分子；LYN-1604上调ATF3和剪切型caspase3的表达，下调RAD21的表达，且该效应可被ULK1沉默逆转[1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
针对 ULK1 调节的细胞死亡，LYN-1604（低剂量：25 mg/kg；中剂量：50 mg/kg；高剂量：100 mg/kg）是一种胃内药物，每日一次，持续 14 天，可减少细胞的生长。异种移植TNBC [1]。
1. TNBC异种移植模型中的抗肿瘤活性：接种MDA-MB-231异种移植瘤的裸鼠（每组6只）接受LYN-1604或溶媒处理。与对照组相比，LYN-1604显著降低肿瘤体积和肿瘤重量（p<0.001，p<0.05）。肿瘤组织免疫组织化学显示，LYN-1604处理组p-ULK1（Ser317）阳性率显著升高。肿瘤组织western blot分析显示，ULK1、p-ULK1（Ser317）、LC3-II、Beclin-1表达上调，PARP发生剪切，与体外自噬和凋亡诱导结果一致[1] 2. 体内安全性：与溶媒组相比，LYN-1604处理未导致小鼠相对体重、肝指数、脾指数或肾指数发生显著变化，表明其体内耐受性良好[1] |
| 酶活实验 |
1. ULK1激酶活性实验（ADP-Glo实验）：将纯化的ULK1激酶与不同浓度的LYN-1604（初始筛选浓度包括100nM）在反应缓冲液中孵育。孵育后加入ADP-Glo试剂终止反应并将ADP转化为ATP，通过检测发光强度（RLU）量化ULK1激酶活性（空白组：无ULK1，0%活性；对照组：无LYN-1604，100%活性），根据标准化激酶活性的剂量-反应曲线计算EC₅₀值[1]
2. 体外磷酸化实验：从HEK-293T细胞中纯化野生型或突变型（K50A、L53A、Y89A）ULK1，以纯化的mATG13为底物，在有无LYN-1604存在的条件下进行反应。通过特异性抗体western blot检测mATG13在Ser318位点的磷酸化水平，并确认酶和底物的上样量一致[1] 3. 表面等离子体共振（SPR）实验：将野生型或突变型ULK1固定在Biacore传感器芯片上，将不同浓度的LYN-1604注入芯片，通过检测SPR信号评估结合亲和力，分析LYN-1604与ULK1的相互作用[1] 4. 分子动力学模拟：对LYN-1604与野生型或突变型ULK1的结合进行10ns的计算模拟。野生型和K50A/L53A突变型的结合构象稳定，而Y89A突变型不稳定，证实Y89在结合中的关键作用[1] |
| 细胞实验 |
细胞活力测定[1]
细胞类型： MDA-MB-231 细胞 测试浓度： 0.5、1.0 和 2.0 μM 孵育时间： 实验结果：诱导细胞死亡。自噬比率以剂量依赖性方式增加。 蛋白质印迹分析[1] 细胞类型： MDA-MB-231 细胞 测试浓度： 0、0.5、1、和 2 μM 孵育时间： 24 小时 实验结果： 诱导 Beclin-1 显着上调和 p62 降解作为 LC3-I 到 LC3-II 的转化。 1. 细胞活力实验（MTT实验）：将MDA-MB-231细胞接种于96孔板，用不同浓度的LYN-1604处理24小时。自噬抑制实验中，在LYN-1604处理前1小时加入3-MA（1mM）。加入MTT试剂后检测吸光度，计算细胞活力，使用Prism 6.0软件测定IC₅₀值[1] 2. 自噬小体检测（MDC染色）：用LYN-1604（0.5μM、1.0μM、2.0μM）处理MDA-MB-231细胞后，加入MDC染色。通过荧光显微镜观察自噬小体，流式细胞术量化MDC阳性细胞比例[1] 3. 自噬流实验：将MDA-MB-231细胞转染GFP/mRFP-LC3质粒，用LYN-1604（2.0μM）在有无巴弗洛霉素A₁（10nM）存在的条件下处理。通过荧光显微镜观察GFP-LC3斑点，western blot检测p62和LC3的表达以评估自噬流[1] 4. Western blot分析：用指定浓度和时间的LYN-1604处理MDA-MB-231细胞，制备细胞裂解液，经电泳分离蛋白后转移至膜上，用抗Beclin-1、p62、LC3、ULK1、p-ULK1（Ser317/Ser757）、ATF3、RAD21、caspase3、PARP和β-肌动蛋白（内参）的抗体进行孵育，检测并量化免疫反应条带[1] 5. 免疫细胞化学：用LYN-1604（2.0μM）处理MDA-MB-231细胞，固定并透化后，加入抗p-ULK1（Ser317）或LC3B的一抗孵育，再加入荧光标记的二抗。DAPI用于核染色，通过荧光显微镜观察并量化蛋白表达[1] 6. 凋亡实验（Annexin-V/PI双染色）：用LYN-1604（2.0μM）处理MDA-MB-231细胞指定时间后，收集细胞并加入Annexin-V和PI染色，流式细胞术分析凋亡比例[1] 7. siRNA转染实验：使用转染试剂将对照siRNA、ULK1 siRNA或ATF5 siRNA转染至MDA-MB-231细胞。转染后用LYN-1604（2.0μM）处理24小时，通过western blot分析或免疫细胞化学检测靶蛋白表达，评估基因沉默对LYN-1604诱导自噬和凋亡的影响[1] 8. 芯片分析：将MDA-MB-231细胞转染ULK1 siRNA或pcDNA3.1-ULK1，提取总RNA并进行芯片分析，鉴定表达变化相反的差异表达基因。通过western blot验证核心ULK1调控基因（包括ATF3、RAD21、caspase3）[1] |
| 动物实验 |
Animal/Disease Models: 24 female nude mice (BALB/c, 6-8 weeks, 20-22 g)[1]
Doses: Low dose, 25 mg/kg; median dose, 50 mg/kg; high dose, 100 mg/kg Route of Administration: intragastric (po) administration; one time/day for 14 days Experimental Results: Dramatically inhibited the growth of xenograft MDA-MB-231 cells. The body weights of mice were stable. By the end of the experiment, the liver and spleen weight indexes of mice were slightly increased in parts of the groups, while the kidney weight index was not affected in all dose groups. 1. TNBC xenograft model establishment: MDA-MB-231 cells in log-phase growth were harvested and resuspended in appropriate medium. Nude mice were inoculated subcutaneously with MDA-MB-231 cells to establish xenograft tumors. Mice were randomly divided into control (vehicle) and LYN-1604-treated groups (n=6 per group) after tumor formation [1] 2. Drug administration: LYN-1604 was dissolved in a suitable vehicle (not specified in detail). The drug was administered to mice via an unspecified route at a median dose and other doses (not explicitly stated) for a specified treatment duration until the study endpoint [1] 3. Data collection and analysis: Tumor volume was measured regularly using calipers (tumor volume = length × width² / 2). At the end of treatment, mice were euthanized, and tumor weight was measured. Relative body weight was recorded throughout the study. Liver, spleen, and kidney were collected to calculate organ indices. Tumor tissues were fixed for immunohistochemistry (detection of p-ULK1) or frozen for western blot analysis (detection of ULK1, p-ULK1, LC3, Beclin-1, PARP) [1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
1. Background: ULK1 is a key initiator of autophagy, and its expression is significantly downregulated in breast cancer tissues, especially in triple-negative breast cancer (TNBC). Activation of ULK1-modulated autophagy is a potential therapeutic strategy for TNBC [1]
2. Chemical structure: The chemical structure of LYN-1604 is provided in Figure 5A of the literature [1] 3. Mechanism of action: LYN-1604 acts as a ULK1 agonist, binding to ULK1 via LYS50, LEU53, and TYR89 residues to activate its kinase activity. It induces ATG5-dependent autophagy through the ULK complex (ULK1-mATG13-FIP200-ATG101) and triggers apoptosis via regulation of ATF3, RAD21, and caspase3, ultimately leading to cell death in TNBC cells [1] 4. Therapeutic potential: LYN-1604 exhibits potent antitumor activity in vitro and in vivo, with good tolerability, making it a promising small-molecule drug candidate for TNBC therapy [1] |
| 分子式 |
C33H43CL2N3O2
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|---|---|---|
| 分子量 |
584.63
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| 精确质量 |
583.273
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| CAS号 |
2088939-99-3
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| 相关CAS号 |
LYN-1604 dihydrochloride;2310109-38-5;LYN-1604 hydrochloride;2216753-86-3
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| PubChem CID |
131801113
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| 外观&性状 |
Colorless to light yellow oil
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| LogP |
7.6
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| tPSA |
36
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
12
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| 重原子数目 |
40
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| 分子复杂度/Complexity |
750
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
DVNVYWLKGWAELS-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C33H43Cl2N3O2/c1-24(2)19-37(20-25(3)4)22-33(39)38-15-13-36(14-16-38)21-32(30-12-11-29(34)18-31(30)35)40-23-26-9-10-27-7-5-6-8-28(27)17-26/h5-12,17-18,24-25,32H,13-16,19-23H2,1-4H3
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| 化学名 |
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.7105 mL | 8.5524 mL | 17.1048 mL | |
| 5 mM | 0.3421 mL | 1.7105 mL | 3.4210 mL | |
| 10 mM | 0.1710 mL | 0.8552 mL | 1.7105 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
dentification of LYN-1604 as a potent ULK1 agonist, and its binding mode.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
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LYN-1604 induces cell death in MDA-MB-231 cells.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
 LYN-1604 induces ATG5-dependent autophagyviathe ULK complex.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
 LYN-1604 induces autophagy involved in ATF3, RAD21, and caspase3.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
|---|
 LYN-1604 has therapeutic potential, targeting ULK-modulated cell deathin vivo.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
 Biological evaluation of candidate ULK1 agonists toward human breast cancer cells.Chem Sci.2017 Apr 1;8(4):2687-2701. |
DCC-3116
NZ-66
MRT68921 hydrochloride
ULK-101
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COA
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463611831
