BLU0588

别名: BLU0588; BLU 0588; BLU-0588; orb1819253; SCHEMBL27203841; BLU-0588
目录号: V69118 纯度: ≥98%
BLU0588 是一种口服有效的特异性 PRKACA(蛋白激酶 cAMP 激活的催化亚基 α)激酶抑制剂(拮抗剂),IC50 为 1 nM,解离常数 (Kd) 为 4 nM。
BLU0588 CAS号: 2810747-78-3
产品类别: PKA
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
BLU0588 是一种口服有效的特异性 PRKACA(蛋白激酶 cAMP 激活的催化亚基 α)激酶抑制剂(拮抗剂),IC50 为 1 nM,解离常数 (Kd) 为 4 nM。 BLU0588 可用于纤维板层癌 (FLC) 研究。
BLU0588 是一种首创的、高选择性的、口服有效的蛋白激酶 A 催化亚基 α (PRKACA) 小分子抑制剂。通过药物化学优化开发,BLU0588 能强效抑制 PRKACA,其生化 IC50 为 1 nM,解离常数 (Kd) 为 4 nM,对密切相关的 AGC 激酶 ROCK2 的选择性超过 80 倍。在细胞实验中,BLU0588 抑制 PRKACA 信号通路的 IC50 为 25 nM(通过检测 VASP Ser157 磷酸化水平降低来衡量)。在由 DNAJB1-PRKACA 基因融合驱动的纤维板层样肝细胞癌 (FLC) 患者来源异种移植 (PDX) 模型中,口服 BLU0588(30 mg/kg,每日一次)可显著抑制肿瘤生长(抑制率达 48.5%),并逆转 FLC 特异性基因表达特征。BLU0588 代表了一种经过验证的 PRKACA 化学探针,是治疗 FLC 及其他 PRKACA 驱动型疾病的有前景的候选药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
PRKACA (protein kinase cAMP-activated catalytic subunit alpha) – IC50 = 1 nM (biochemical assay); Kd = 4 nM; cellular IC50 = 25.0 nM (inhibition of VASP Ser157 phosphorylation in forskolin-stimulated Huh7 cells) [1]
ROCK2 – IC50 = 83.1 nM (83-fold selective over PRKACA) [1]
AKT1 – IC50 = 1540 nM; AKT2 – IC50 = 3780 nM; AKT3 – IC50 = 397 nM [1]
体外研究 (In Vitro)
BLU0588在生化测定中使用Kemptide肽底物和Km浓度ATP(5 μM)抑制PRKACA催化活性,IC50为1 nM。[1]
BLU0588抑制PRKACA细胞活性,IC50为25.0 nM,通过抑制佛司可林刺激的Huh7细胞中VASP Ser157磷酸化测定。[1]
在FLC PDX球体培养中,BLU0588处理导致磷酸化VASP呈剂量依赖性降低,表明PRKACA信号被抑制。在FLC PDX球体模型中,BLU0588处理未显著抑制增殖。[1]
BLU0588处理(1.5 μM,1天或14天)逆转了FLC特异性基因特征,导致FLC中过表达的基因(CPS1和G6PC)下调和FLC中低表达的基因(PYGL和SHH)上调。这些基因表达效应的IC50值在55 nM至180 nM之间。[1]
BLU0588调节FLC PDX细胞中的基因表达,与DMSO对照相比有817个蛋白编码基因差异表达(323个负向变化,494个正向变化)。BLU0588调节的基因列表与PRKACA shRNA调节的基因列表显著重叠(N = 206,Fisher精确检验P < 2.2 × 10⁻¹⁶),定义了PRKACA抑制的特征。[1]
BLU0588对密切相关的AGC激酶家族成员表现出良好至中等的选择性,并具有优异的整体激酶组选择性,S(10)选择性评分为0.047。在3 μM浓度下对400个人类激酶面板进行激酶组-wide选择性评估。在3 μM筛选浓度下,BLU0588与有限数量的激酶结合,结合率>90%。Kd测量显示对PRKACA的结合亲和力最强,为4 nM,仅对9种非突变激酶的Kd < 100 nM。[1]
BLU0588(1.5 μM,1 天或 14 天)可逆转 FLC 特有的基因特征,导致 FLC 过表达基因(如 CPS1 和 G6PC,上图)和 FLC 表达不足的基因下调 [1]。 BLU0588 (0-312.5 nM) 剂量依赖性地降低 FLC PDX 细胞中的 pVASP[1]。
体内研究 (In Vivo)
在携带FLC PDX肿瘤的小鼠中,口服BLU0588 30 mg/kg每日一次,持续34天,与溶媒对照相比肿瘤生长抑制48.5%(P = .003)。[1]
在药代动力学/药效动力学研究中,BLU0588 30 mg/kg每日一次给药后4小时,磷酸化VASP降至基线水平的19%;75 mg/kg每日一次给药后,磷酸化VASP降至基线水平的4%。30 mg/kg每日一次给药后24小时,磷酸化VASP水平完全恢复。[1]
口服 BLU0588 (30-75 mg/kg) 可有效抑制 PRKACA 下游信号传导,并在 24 小时内使磷酸化 VASP 水平恢复至基线水平[1]。在三周的时间里,小鼠接受每日最大耐受剂量 30 mg/kg 的 BLU0588[1]。在小鼠中,BLU0588(30 mg/kg,每天一次,口服)可抑制肿瘤的形成[1]。
酶活实验
PRKACA生化抑制实验:将PRKACA酶(0.007 ng/mL)加入到384孔板的每个孔中,孔中含有1 μM Kemptide肽底物(5-FAM-LRRASLG)、Km浓度ATP(5 μM)和系列浓度的测试化合物(终浓度1% DMSO),缓冲液为100 mM HEPES pH 7.5、0.015% Brij-35、10 mM MgCl2、1 mM DTT,在25°C孵育90分钟。加入终止缓冲液终止反应。使用电泳迁移率变动平台读取结果,使用4参数拟合计算IC50。[1]
ROCK2实验:使用ROCK2酶(0.006 ng/mL),条件类似。[1]
AKT1-3实验:测试化合物在100% DMSO中用3倍稀释步骤稀释。最终化合物浓度范围为10 μM至0.056 nM,终DMSO浓度为1%。以星形孢菌素作为参考化合物。[1]
激酶组-wide选择性分析:使用KINOMEscan方法在3 μM浓度下测试BLU0588对400个人类激酶面板的结合。对于在3 μM筛选浓度下结合率>90%的所有非突变激酶,测定Kd值。[1]
细胞实验
PRKACA细胞活性测定(HTRF):使用VASP Ser157磷酸化作为PRKACA细胞活性的读数。将Huh7细胞以每孔2 × 10⁴个细胞接种于384孔optiwell板的无血清无酚红DMEM中,过夜培养。加入测试化合物(终浓度0.24% DMSO),细胞孵育4小时。加入佛司可林(终浓度5 μM),板孵育30分钟。用含Halt蛋白酶抑制剂混合物的裂解缓冲液裂解细胞。将裂解液转移至384孔proxi板,加入预混合的抗体溶液(磷酸化VASP隐蔽抗体和磷酸化VASP d2抗体)。在EnVision仪器上读取665 nm和620 nm的荧光发射。[1]
FLC PDX球体培养:用胶原酶B解离FLC PDX肿瘤,使用小鼠细胞去除试剂盒去除小鼠细胞。解离的细胞在含20 ng/mL EGF、10 ng/mL FGF、2% B27和1% N2的DMEM/F-12中于低吸附板上培养为球体。对于BLU0588处理,球体用BLU0588处理4小时(用于Western blot)或14天(用于增殖和基因表达)。[1]
细胞增殖实验:用不同浓度的BLU0588、星形孢菌素或DMSO溶媒处理FLC PDX球体。14天后使用CellTiter-Glo发光细胞活力测定法检测增殖。[1]
定量PCR:使用RNeasy Plus Mini Kit提取总RNA,逆转录为cDNA。使用TaqMan基因表达测定法检测PYGL、SHH、CPS1和G6PC的表达。使用2⁻ΔΔCt法计算相对定量,并归一化至管家基因对照。[1]
转录组测序:对BLU0588或DMSO处理的FLC PDX细胞进行RNA测序。使用DESeq2评估差异基因表达,假发现率阈值0.01,绝对log2倍数变化阈值1。[1]
Western blot分析:细胞在含Halt蛋白酶抑制剂混合物的PhosphoSafe提取试剂中裂解。蛋白通过20%梯度凝胶SDS-PAGE分离,电转移至硝酸纤维素膜。使用抗PRKACA、pVASP、pCREB、ROCK和β-actin上样对照的一抗进行免疫检测。[1]
动物实验
动物/疾病模型: 携带 FLC PDX 肿瘤的雌性 NOD-SCID(严重联合免疫缺陷)小鼠(6-8 周龄,植入 FLC PDX shRNA 细胞系或 Hep3B 细胞)[1]
剂量: 30 mg/kg
给药途径: 口服,每日一次,持续 34 天
实验结果: 抑制小鼠肿瘤生长,到第 34 天,肿瘤生长抑制了 48.5%。
药代性质 (ADME/PK)
在小鼠中口服BLU0588 30 mg/kg和75 mg/kg每日一次后,血浆浓度在给药后2-4小时内达到峰值。BLU0588治疗小鼠中,30 mg/kg每日一次给药后4小时,磷酸化VASP降至基线水平的19%;75 mg/kg每日一次给药后降至基线水平的4%。30 mg/kg每日一次给药后24小时,磷酸化VASP水平完全恢复。[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在28天大鼠耐受性研究中,15 mg/kg/天的剂量水平耐受良好,未观察到临床症状。最高剂量组(30 mg/kg)的动物在几天后活动减少,随后在6-7天后死亡。这些动物的死亡原因未确定。BLU0588在连续给药超过3周的小鼠中的最高耐受剂量确定为30 mg/kg每日一次。[1]
参考文献

[1]. Evaluation of Protein Kinase cAMP-Activated Catalytic Subunit Alpha as a Therapeutic Target for Fibrolamellar Carcinoma. Gastro Hep Advances. 2022 Nov 8;2(3):307-321.

其他信息
BLU0588是一种新型选择性PRKACA小分子激酶抑制剂,通过对从包含10,000多种化学多样性激酶抑制剂的专有化合物库中筛选得到的高通量筛选命中化合物进行迭代药物化学优化而开发。它是一种ATP竞争性抑制剂。BLU0588处理导致FLC PDX球体培养中磷酸化VASP呈剂量依赖性降低,体内治疗使FLC PDX肿瘤生长减少约50%。BLU0588和BLU2864是首次报道的选择性小分子PRKACA酶抑制剂。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H25N5O
分子量
423.509605169296
精确质量
423.205
CAS号
2810747-78-3
PubChem CID
164603520
外观&性状
White to yellow solid powder
LogP
3.3
tPSA
73.9
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
667
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C1CCN(C1)[C@@H]2CC3=CC=CC=C3[C@H]2NC(=O)C4=CN=C(C=C4)C5=C6C=CNC6=NC=C5
InChi Key
YXSWSKFLTNJZEO-DNQXCXABSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H25N5O/c32-26(18-7-8-22(29-16-18)20-9-11-27-25-21(20)10-12-28-25)30-24-19-6-2-1-5-17(19)15-23(24)31-13-3-4-14-31/h1-2,5-12,16,23-24H,3-4,13-15H2,(H,27,28)(H,30,32)/t23-,24-/m1/s1
化学名
N-[(1R,2R)-2-pyrrolidin-1-yl-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-6-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide
别名
BLU0588; BLU 0588; BLU-0588; orb1819253; SCHEMBL27203841;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3612 mL 11.8061 mL 23.6122 mL
5 mM 0.4722 mL 2.3612 mL 4.7224 mL
10 mM 0.2361 mL 1.1806 mL 2.3612 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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