PF-429242

别名: PF 429242; PF-429242; PF429242 4-[(二乙基氨基)甲基]-N-[2-(2-甲氧基苯基)乙基]-N-(3R)-3-吡咯烷基苯甲酰胺; (R)-4-((二乙基氨基)甲基)-n-(2-甲氧基苯乙基)-n-(吡咯烷-3-基)苯甲酰胺
目录号: V4144 纯度: ≥98%
PF429242 (PF-429242) 是一种新型、有效、可逆和竞争性的 S1P[甾醇调节元件结合蛋白 (SREBP) 位点 1 蛋白酶]抑制剂,IC50 为 170 nM。
PF-429242 CAS号: 947303-87-9
产品类别: S1P Receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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Other Forms of PF-429242:

  • PF-429242 dihydrochloride
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
PF429242 (PF-429242) 是一种新型、有效、可逆和竞争性 S1P [甾醇调节元件结合蛋白 (SREBP) 位点 1 蛋白酶] 抑制剂,IC50 为 170 nM。 PF 429242 在浓度高达 100 μM 时,对胰蛋白酶、弹性蛋白酶、蛋白酶 K、纤溶酶、激肽酶、因子 XIa、凝血酶或弗林蛋白酶没有显着抑制作用,对尿激酶 (IC50 = 50 μM) 和因子 Xa (IC50 = 100) 仅有适度抑制作用。微米)。 PF-429242 对位点 1 蛋白酶具有选择性,而针对一组丝氨酸蛋白酶。 PF-429242 抑制 CHO 细胞中胆固醇合成速率,IC50 为 0.53 μM。
生物活性&实验参考方法
靶点
S1P ( IC50 = 170 nM )
PF-429242 suppresses the expression of important genes involved in the synthesis of fatty acids and cholesterol, stops the nuclear translocation of SREBP, and inhibits both pathways in cultured human liver (Hep-G2) cells without causing any cytotoxicity[1]. In various cells derived from primates, the addition of PF-429242 inhibits the viral propagation of all DENV serotypes[2].
体外研究 (In Vitro)
10 μM PF-429242 扩增中国仓鼠细胞中的内源性 SREBP 加工。PF-429242 还电泳人肾 293 细胞中 SRE-荧光素酶报告基因的信号以及培养的 HepG2 细胞中内源性 SREBP 靶基因在HepG2细胞中,PF-429242悬浮液合成,IC50为0.5 μM[1]。添加PF-429242 (30 μM)可显着着悬浮细胞培养液中的感染性病毒滴度和病毒RNA拷贝。 -429242处理还显示对人源HEK-293、Hep G2和非人灵长类动物源LLC-MK2细胞液中DENV2产量培养的抑制作用[2]。 PF-429242有效阻止原型沙粒病毒性脉络丛脑膜炎病毒 (LCMV) 和 LASV 对 GPC 的加工,这与该化合物在培养细胞中对 LCMV 和 LASV 的强效抗病毒活性相关[3]。
在培养的人肝癌Hep-G2细胞中,PF-429242 能阻止固醇调节元件结合蛋白(SREBP)的蛋白水解加工和核转位,在10 µM浓度下观察到完全抑制。[1]
该化合物能降低Hep-G2细胞中参与胆固醇合成(例如HMG-CoA合酶;EC₅₀ = 0.3 µM)和脂肪酸合成(例如脂肪酸合酶;EC₅₀ = 2 µM)的关键基因的表达。[1]
PF-429242 能抑制Hep-G2细胞中的胆固醇合成(EC₅₀ = 600 nM)和脂肪酸合成(在10 µM时抑制43%),且不引起细胞毒性(通过乳酸脱氢酶释放实验评估)。[1]
PF-429242 也能抑制LDL受体基因表达和LDL受体介导的LDL内化,但程度低于其对胆固醇合成的抑制。在能产生65%胆固醇合成抑制的浓度下,LDL受体介导的LDL内化未发生改变;在能抑制胆固醇合成>90%的浓度下,LDL受体介导的LDL内化仅被抑制35%。[1]
体内研究 (In Vivo)
在用PF-429242处理24小时的小鼠中,单个SREBP靶基因的表达受到抑制,单个细胞和培养基合成率降低[1]。
在雄性CD1小鼠中,腹腔注射PF-429242(10和30 mg/kg/剂量,每6小时一次,持续24小时)导致两种剂量下肝脏HMG-CoA合酶基因表达均降低超过80%。[1]
观察到脂肪酸合酶基因表达的剂量依赖性降低(10和30 mg/kg/剂量下分别降低50%和75%)以及胆固醇和脂肪酸合成途径的抑制(10 mg/kg/剂量下两条途径均抑制50%;30 mg/kg/剂量下两条途径均抑制80%)。[1]
LDL受体基因表达在10 mg/kg/剂量下未发生显著改变,但在30 mg/kg/剂量下降低了35%。[1]
酶活实验
使用MCA偶联的肽底物Ac-VFRSLK-MCA,通过荧光法测量S1P的酶活性和抑制。反应在96孔板中进行,总体积为40 µL。荧光肽底物浓度为20 µM,纯化的His标签人源S1P酶(从稳定转染的CHO-K1细胞分泌,通过镍柱亲和层析纯化)浓度为25 µg/mL(1 µg/孔)。反应在37°C下进行4小时。溶于DMSO的测试化合物被加入,使最终DMSO浓度为2.5%。在激发波长360 nm、发射波长460 nm下测量荧光。[1]
细胞实验
HeLa 细胞在添加了 2% FCS 和 0.2 mM 非必需氨基酸且含有 3 至 300 µM PF-429242 的培养基中培养。给药 72 小时后,向培养的细胞给予 CellTiter-Glo 混合物,并使用 ARVO MX/Light 1420 Multilabel/Luminescent 计数器测量细胞内 ATP 的发光强度。
培养Hep-G2细胞并用PF-429242处理。评估SREBP的蛋白水解加工和核转位。使用既定方法测量HMG-CoA合酶、脂肪酸合酶和LDL受体的基因表达。定量胆固醇和脂肪酸的合成。通过测量LDH释放评估细胞毒性。使用荧光标记的LDL探针测量LDL受体介导的LDL内化。[1]
动物实验
Male CD1 mice (n = 5 per group) were administered PF-429242 intraperitoneally every 6 hours for 24 hours at doses of 10 and 30 mg/kg/dose. After 24 hours, hepatic tissues were collected for gene expression analysis and measurement of cholesterol and fatty acid synthesis pathways. [1]
药代性质 (ADME/PK)
In rats, PF-429242 exhibited rapid clearance (CL = 75 mL/min/kg) and poor oral bioavailability (5%). The high clearance was not predicted by in vitro studies using human liver microsomes. [1]
Based on pharmacokinetic modeling, intraperitoneal administration every 6 hours for 24 hours at a dose of 30 mg/kg/dose was determined to provide sufficient exposure for assessing acute (24-hour) in vivo efficacy. [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
In Hep-G2 cells, PF-429242 did not induce cytotoxicity at concentrations up to 10 µM, as measured by LDH release assay. [1]
参考文献

[1]. Bioorg Med Chem Lett . 2007 Aug 15;17(16):4411-4.

[2]. Viruses . 2016 Feb 10;8(2):46.

其他信息
PF-429242 is an aminopyrrolidineamide derivative identified as a potent and selective S1P inhibitor from a high-throughput screening campaign. It represents one of the first reported small-molecule inhibitors of S1P. [1]
The compound inhibits the S1P-mediated cleavage of SREBP, a key transcription factor regulating genes involved in cholesterol and fatty acid metabolism. This mechanism provides a potential approach to simultaneously inhibit both cholesterol and fatty acid synthesis pathways. [1]
PF-429242 was selected for further evaluation from a series of analogs due to its reasonable potency, lower molecular weight, and lower lipophilicity compared to other potent compounds. The active enantiomer (PF-429242) was assigned the R configuration. [1]
The study suggests that S1P inhibition is an attractive therapeutic target for treating dyslipidemia and cardiometabolic risk factors associated with altered cholesterol and fatty acid metabolism. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H35N3O2
分子量
409.5643
精确质量
409.272
元素分析
C, 73.31; H, 8.61; N, 10.26; O, 7.81
CAS号
947303-87-9
相关CAS号
PF429242 dihydrochloride; 2248666-66-0
PubChem CID
23661637
外观&性状
Solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
562.2±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
293.8±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.5 mmHg at 25°C
折射率
1.586
LogP
2.88
tPSA
44.81
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
503
定义原子立体中心数目
1
SMILES
N([C@H]1CNCC1)(CCC1C=CC=CC=1OC)C(C1C=CC(CN(CC)CC)=CC=1)=O
InChi Key
XKPJTOHUPQWSOJ-HSZRJFAPSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H35N3O2/c1-4-27(5-2)19-20-10-12-22(13-11-20)25(29)28(23-14-16-26-18-23)17-15-21-8-6-7-9-24(21)30-3/h6-13,23,26H,4-5,14-19H2,1-3H3/t23-/m1/s1
化学名
4-(diethylaminomethyl)-N-[2-(2-methoxyphenyl)ethyl]-N-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]benzamide
别名
PF 429242; PF-429242; PF429242
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~82 mg/mL (~200.2 mM)
Water: ~82 mg/mL
Ethanol: ~82 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4416 mL 12.2082 mL 24.4164 mL
5 mM 0.4883 mL 2.4416 mL 4.8833 mL
10 mM 0.2442 mL 1.2208 mL 2.4416 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • DENV suppression via the addition of PF-429242. Viruses . 2016 Feb 10;8(2):46.
  • Cytotoxicity and inhibitory concentrations of PF-429242 in HeLa cells infected with DENV. Viruses . 2016 Feb 10;8(2):46.
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